Fueron sus padres hidalgos de solar conocido, como tantos pobladores de la Nueva Espana. El se llamaba Pedro Ruiz de Alarcon y sus progenitores fueron vecinos de Albaladejo, en Cuenca; era fama que descendia de la rama de los Alarcones a la que pertenecio don Hernando de Alarcon, Marques de Valsiciliana, custodio del Rey de Francia Francisco I en la ciudadela de Pizzighettone, despues del desastre de Pavia.En la segunda mitad del siglo xvi abundan entre los Alarcones los hidalgos pobres pero celosos de su calidad y prerrogativas, sobre todo en las villas y pueblos de lo que es ahora la provincia de Cuenca: la ciudad de Cuenca, Buenache, Villalgordo, Talayuelas, Alarcon, Cerbera, HinojOa, Alcanahate, Alberca y Albaladejo.La madre de Alarcon, dona Leonor de Mendoza, era hija de Hernando de Mendoza (a quien tambien se le nombra Hernando Hernandez de Cazalla) y de Maria de Mendoza, que estaban radicados en el mineral de Tasco desde antes de 1572. Sera esta la dona Maria de Mendoza que, en la informacion de los conquistadores y primeros poeladores hecha entre 1540 y 1550, declaraba ser soltera e hija legitima de un Alonso de Mendoza, que vino a la Nueva Espana con Panfilo de Narvaez, estuvo en el sitio de Tenochtitlan, fue enviado por Cortes y a su regreso murio dejandola pobre Porque nunca fue remunerado mas de un corregimiento, y que en el dicho viaje gasto cuanto tenia? Dona Leonor de Mendoza fue tenida siempre por mujer noble y principal, y es posible que estuviera emparentada con la ilustre familia de los Mendoza. No hay datos, sin embargo, de que ninguno de los padres de nuestro poeta haya sido reconocido por las familias que heredaron los titulos de las casas de Mendoza y Alarcon, y que desde lejos daban cierto reflejo de grandeza a su numerosa e ignorada parentela.