La continuación de la exitosa obra de Nobuyuki Anzai que actualmente está terminando de publicar Ivrea. Tras que Anzai anunciara su retiro, la realización de MÄR Omega quedó a cargo de Kouichiro Hoshino. La historia ahora se centra en Kai, un chico que idolatra a Ginta (el prota del anterior manga) tras su participación en el final de la anterior historia. Desde aquello, los ARMs se conviertieron en algo común, especialmente para ser usados como guardianes. ¡Kai quiere uno! De repente se topa con Babbo, el ARM que tenía Ginta, que se quedará con él. Pero no todo es alegría, ya que los falsos ARMs se han puesto fuera de control. Kai se verá obligado a seguir los pasos de su ídolo Ginta.